Başkent Üniversitesi, 14 Eylül 1993 tarihinde 515 sayılı Hükümet Kararnamesi ile 14 Ocak 1994 tarihi ve 3961 sayılı yasasıyla kurulmuş kamu tüzel kişiliğine sahip bir vakıf üniversitesidir.
Türkiye Organ Nakli ve Yanık Tedavi Vakfı tarafından 1982 yılında başlatılan sağlık çalışmaları bugün 57.505 metrekare kapalı alan, 79’u yoğun bakım olmak üzere merkezde 368 yatak, Ayaş Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon Merkezi’nde 90 yatak ve Yapracık Psiko-Sosyal Rehabilitasyon Merkezi’nde 68 yatak (28 yatak palyatif bakım ünitesinin) ile toplam 526 yatak kapasitesiyle hizmet veren, modern ve teknolojik yapısıyla desteklenen laboratuar, görüntüleme üniteleri ile ameliyathanelere sahip tanı ve tedavi merkezidir. 16 adet ameliyathanesiyle 24 saat kesintisiz hizmet veren hastanede, günübirlik ayaktan hastaların servise alınmadan kabul edildiği bir ünite bulunmaktadır. Bu ünite ayrıca 6 yataklı gözlem odasıyla desteklenmektedir. Hastanenin sağlık sunumunda; hekimlerin, ekipmanların, teknik donanımın yanı sıra artan hasta talebine yanıt verebilmek ve hastalara sunduğu sağlık hizmetinin modern fiziki ortamda sağlanabilmesi için 2010 yılı ocak ayı itibariyle bir dizi çalışma başlatmış bulunmaktadır. Hastaneden hizmet alan hasta ve hasta yakınlarına sunduğumuz sağlık hizmetinin en konforlu şekilde sağlanabilmesi ve hastaneye olan artan talebi yanıtlayabilmek için 2012 yılı içerisinde hastalara yenilenen yüzüyle hizmet sunumuna devam etmektedir. Başkent Üniversitesi Ankara Hastanesi bünyesinde bulunan; Organ nakli merkezi, Tüp Bebek Merkezi, Genetik Hastalıklar Tanı Merkezi ile buna bağlı olarak Ayaş Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon Merkezi, Çiğdem Diyaliz Merkezi, Yenikent Diyaliz Merkezi, Yenikent Semt Polikliniği, Ümitköy Semt Polikliniği ve Ümitköy Diyaliz Merkezi’yle Ankara’nın farklı lokasyonlarında hastalara hizmet sunmaktadır. Başkent Üniversitesi Hastaneleri ile Uygulama ve Araştırma Merkezlerinde kalite iyileştirme çalışmaları 1997 yılından itibaren sürdürülmekte, tüm merkezlerimizde ISO 9001:2015 Kalite Yönetim Sistemi Standartının gereklilikleri yerine getirilmekte ve merkezimiz Türk Standartları Enstitüsü tarafından belgelendirilmektedir. Bununla birlikte hastane ilk ISO kalite belgesini alan vakıf hastanesi olma özelliğini taşımaktadır. Bebek Dostu Hastane belgesine sahip bir hastanedir.